Музейные экспозиции построены по хронологическому принципу в четырёх залах и представляют все многообразие природы и истории края с древнейших времен до наших дней:
1 - «Археология. Освоение Приамурья»,
2 - «Михайловский район в 1917 – 1941 годах»,
3 - «Михайловцы в годы Второй мировой войны. Михайловцы – участники «горячих точек»,
4 - «Животный мир Амурской области»
и выставочный зал.
В зале №1 «Археология. Освоение Приамурья» представлены археологические находки с памятника международного значения Гора-Шапка – фрагменты керамики, стрелы и украшения.
В отделе освоения имеются подлинные фотографии, предметы быта казаков и крестьян-переселенцев.
Во втором зале отражена история Михайловского района в 1917 – 1941 годах. В экспозиции – коллекция фрагментов оружия, фотоматериалы и документы красного и белого движения, японской интервенции. Среди предметов истории коллективизации особый интерес представляют американский плуг к трактору «Фордзон», советская нумизматика, пионерская и октябрятская символика. Здесь же помещены материалы о репрессиях 1930 – 1950-х годов.
В следующем зале отражена тема участия михайловцев во Второй мировой войне и в «горячих точках» страны. Дух сурового военного времени передан подлинными фотографиями, документами участников войны, а также фрагментами оружия, немецкими трофейными предметами, здесь же расположена витрина, посвящённая Эдуарду Положиёву, погибшему в Чечне.
В зале №4 размещены чучела зверей и птиц, коллекция рыб, змей и земноводных.
В выставочном зале №5 экспонирование постоянно обновляется, также периодически вносятся изменения в постоянные экспозиции.
